ตามที่ สมาคมกีฬาฟุตบอลแห่งประเทศไทย ประกาศยุติการแข่งขันฟุตบอลภายใต้การกำกับของสมาคมฯ ในฤดูกาลแข่งขัน 2559 เพื่อถวายความอาลัย และสำนึกในพระมหากรุณาธิคุณ พระบาทสมเด็จพระปรมินทรมหาภูมิพลอดุลยเดช โดยผลยึดอันดับสิ้นสุด ณ วันที่ 14 ต.ค. ส่วนรายการทัวร์นาเมนท์ ให้ใช้วิธีจับสลากจัดอันดับ ตามประกาศเมื่อ 14 ต.ค. ต่อมาวันที่ 15 ต.ค. สมาคมฯ มีประกาศทบทวนคำประกาศเดิม หลังจากรัฐบาลอนุญาตให้การแข่งขันกีฬาสามารถจัดต่อไปได้ ขณะเดียวกัน มีสโมสรที่แถลงการณ์แสดงจุดยืนว่าจะยุติการแข่งในฤดูกาลนี้ คือ บุรีรัมย์ ยูไนเต็ด, ซุปเปอร์ พาวเวอร์-สมุทรปราการ, เชียงราย ยูไนเต็ด, สุพรรณบุรี เอฟซี ในโตโยต้าไทยลีก, ประจวบ เอฟซี ในยามาฮ่า ลีก ดิวิชั่น 1
เมื่อวันที่ 17 ต.ค. ที่สโมสรตำรวจ สมาคมกีฬาฟุตบอลฯ ได้เชิญสโมสรต่างๆ มาแสดงความคิดเห็นต่อสภากรรมการ เพื่อทบทวนแนวทางการจัดแข่งขัน โดยก่อนประชุม พล.ต.อ.สมยศ พุ่มพันธุ์ม่วง นายกสมาคมฯ กล่าวกับสโมสรว่า สาเหตุที่ตนตัดสินใจนี้ เนื่องจากเป็นการแสดงความอาลัยการสวรรคตของ พระบาทสมเด็จพระปรมินทรมหาภูมิพลอดุลยเดช ทั้งนี้ เมื่อวันที่ 14 ต.ค. กระทรวงการท่องเที่ยวและกีฬา ประสานงานผ่านการกีฬาแห่งประเทศไทย ขอความร่วมมือให้งดจัดการแข่งขัน 30 วัน จึงนำเรื่องเข้าที่ประชุมสภากรรมการเร่งด่วน ในวันเดียวกัน ก่อนตัดสินใจยุติการแข่งขัน ด้วยเหตุผลคือ หากเลื่อนแข่ง 30 วัน ไปเริ่มอีกที 15 พ.ย. จะมีผลต่อสัญญานักเตะต่างชาติ ที่สิ้นสุดเดือน ต.ค., ส่งชื่อทีมไปแข่งบอลสโมสรเอเชียไม่ทันตามกำหนด สมาพันธ์ฟุตบอลแห่งเอเชีย(เอเอฟซี), ผู้สนับสนุนหลักแต่ละรายการเห็นควรยุติการแข่งขัน นอกจากนี้ ยังมีคิวแข่งขันของทีมชาติไทยรออยู่ในช่วงปลายปี จากนั้น ได้เชิญผู้แทนแต่ละสโมสรเข้าแสดงความเห็นทีละทีม
หลังการประชุม พล.ต.อ.สมยศ กล่าวว่า จากการขอมติ 18 ทีมไทยลีก ในเรื่องยุติการแข่งขัน มติสโมสร เห็นด้วย 17 ทีม ไม่เห็นด้วย 1 ทีม ส่วนประเด็นเลื่อนชั้น ตกชั้น ปีหน้าให้คงไว้ที่ 18 ทีม มีทีมสนับสนุน 9 ทีม, ให้เพิ่ม 20 ทีม มีสนับสนุน 6 ทีม ส่วนอีก 3 ทีม แล้วแต่สมาคมฯ พิจารณา
ด้านบอลถ้วย เอสซีจี เมืองทองฯ กับ บุรีรัมย์ ยูไนเต็ด ครองแชมป์ร่วมกัน แบ่งเงินรางวัล ให้ไปแบ่งสิทธิลงเล่น โตโยต้า พรีเมียร์คัพ กับ แม่โขง คลับ ขณะที่ ช้างเอฟเอคัพ ชัยนาท ฮอร์นบิล, ชลบุรี เอฟซี, สุโขทัย เอฟซี และ ราชบุรี มิตรผล ครองแชมป์ร่วม แบ่งเงินรางวัล ส่วนสิทธิไปเล่นเอเอฟซีแชมเปี้ยนส์ลีก ให้จับสลาก ซึ่ง ชลบุรี สละสิทธิ
ส่วนทีมชาติไทย แมตช์ฟุตบอลโลกกับ ออสเตรเลีย วันที่ 15 พ.ย. ทางออสซี่ไม่สะดวกไปเป็นเจ้าบ้าน และไม่สะดวกใช้สนามกลาง จึงจะให้แข่งที่สนามราชมังคลากีฬาสถานดังเดิม แต่อาจมีมาตรการด้านการเชียร์
ผลดังกล่าว ทำให้ในไทยลีก เอสซีจี เมืองทอง ยูไนเต็ด คว้าแชมป์ ขณะที่ทีมตกชั้นคือ อาร์มี่ ยูไนเต็ด, ชัยนาท ฮอร์นบิล และ บีบีซียู เอฟซี โดย ไทยฮอนด้า, อุบล ยูเอ็มที กับ การท่าเรือ ขึ้นชั้นมาแทน
ขณะที่นายอนุรุทธิ์ นาคาศัย รองประธานสโมสรชัยนาท ฮอร์นบิล ซึ่งเป็นทีมที่ได้รับผลกระทบ ตกชั้นสู่ดิวิชั่น 1 ได้ร้องเรียนขอความเป็นธรรม ก่อนเข้าไปพูดคุยกับนายกสมาคมกีฬาฟุตบอลฯ
นายอนุรุทธิ์ เปิดเผยว่า ผิดหวังกับผลที่ออกมา เพราะชัยนาท และอาร์มี่ ได้รับผลกระทบตกชั้น ซึ่งไม่แน่ใจว่าการลงคะแนนเสียงมีความยุติธรรมหรือไม่ เพราะตอนแรกสมาคมเรียกเข้ามาประชุมหารือ แต่เปลี่ยนเป็นการชี้แจง และเรียกให้ลงคะแนนลับ จึงคิดว่าไม่ถูกต้อง ทั้งนี้ ชัยนาทจะมีการประชุมกันเพื่อดำเนินการอย่างไรต่อไป ทั้งการยื่นฟ้องร้องต่อศาลกีฬาโลก, ฟีฟ่า และเอเอฟซี รวมทั้งอาจทำตามแนวทางของนายอนุชา นาคาศัย ประธานสโมสรคือการยุบทีม ซึ่งชัยนาทจะมีแถลงการณ์ภายใน 1-2 วันนี้